GENOMIKA előadás – prezentációs forgatókönyv + illusztrációk 1.0

Megjegyzések:

Ezt  most főleg azért küldöm, hogy lássátok, milyen súlyú lesz a feladat, illetve hogy Ti is gondolkodjatok a megoldási lehetőségeken -  pl. mit lehet érdemben kiváltani a PREZI használatával, próbáltuk ebben az irányban optimalizálni.

Ami a képeket illeti: néhányhoz adok URL-t, de azt kérem, hogy ezeket profi képadatbázisokból keressék majd elő a grafikusok, a gyártó cégnek biztosan lesznek fotógyűjteményei. Így lesznek csak a képek egyenletesen jó minőségűek.

Az animációknál szeretném majd a grafikusokat/programozókat szóban is instruálni az elején, ez hatékony megoldás lehet az idő rövidsége miatt.

Az előadás címe: Az egészség és a betegség komplex szemlélete a genomikai tudás tükrében

Előadó: Falus András

Előadó: Félperces erős felütés: eljutunk-e valaha addig, hogy a DNS-ed alapján megmondjuk, mi lesz a sorsod? 2012-ben az Ön ujjbegyéből vett vérből megmondják, mitől fog meghalni; sorban fedezzük fel az egyes tulajdonságok génjeit, pl. a sörhas génjét, az édesszájúság génjét, a jó és rossz lelki tulajdonságok génjeit stb.

1. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: SÖRHASÚ PASI (két kép egy képen: klasszikus sörhas, mellette durva úszógumi-jellegű hízás, mindketten férfiak)

2. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: KISGYEREK BELENYÚL EGY TORTÁBA

3. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: JÓ ÉS ROSSZ ÁBRÁZOLÁSA EGY KÉPEN

Például:

Előadó: Mindebből egy szó sem igaz. Mi az, amit tudunk? Először lássuk, hogy hol vagyunk.

4. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ a méretekről

Ezt kellene megcsinálni, magyar feliratokkal (ezeket majd megadom): http://learn.genetics.utah.edu/content/begin/cells/scale/ (húzzátok a kép alatt a csúszkát, szenzációs)

Kérdés: ki lehet-e váltani PREZI-vel és statikus képekkel?

5. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ: emberi testtől egészen a genomig bezoomolunk

minta:

http://learn.genetics.utah.edu/content/begin/tour/ - itt a What is DNA? Menüpontnál elinduló animáció első fele

egy másik minta:

http://www.youtube.com/watch?v=VcN1mggHzpc&feature=related

Megjegyzés: ez a fajta animált bezoomolás kellene; ehhez képeket, ábrákat adnánk; ezt a megközelítést több animációnál is alkalmaznánk

Előadó: 2003-ban úgy éreztük, hogy valami most megoldódik, mert elkészült a genomszekvencia; azt hittük, hogy hamarosan kezdődhet a személyre szabott orvoslás; ez egy idealista, boldog világnézet volt.

6. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: GENOMSZEKVENCIA; Lévai Péteréknél lévő szuperszámítógép; a kép másik felén genomikai adathalmaz (erről képeket adok)

6/a: előző ábrából egy áttűnéssel egy szemléltető ábra:

Előadó: azóta kiderült, hogy a genetikai háttér mellett a környezet szerepe is óriási. Mit öröklünk és mit nem? Számít, hogy hol élünk, mit eszünk, mennyit mozgunk stb.

7. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: EGYPETÉJŰ IKREK (HASONLÓAK)

Mark Kelly és Scott Kelly amerikai űrhajósok

http://spaceflight.nasa.gov/gallery/images/shuttle/sts-124/hires/jsc2008e038906.jpg

8. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: EGYPETÉJŰ IKREK (NEM HASONLÓAK)

Ide megköszönnék valami híres ikerpárról javaslatot, esetleg a művészvilágból?

9. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: SPORTOLÁS

Tömegsport

10. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: EVÉS

Egy egészségesen kinézetű, vékony és egy iszonyatos kövér ember egy képen

11. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: hogyan károsít egyszerre 3 generációt egy környezeti hatás?

Ezt kell megrajzolni:

Cím: Hogyan károsít egyszerre 3 generációt egy környezeti hatás?

Anya (első generáció)

Magzat (második generáció)

A magzat ősivarsejtjei (harmadik generáció)

Előadó: 2003 óta nagyon komoly szakmai fejlemények: SNP-k (pontmutációk), CGH (comparative genome hibridizáció), CNV-k; mikroRNS-ek (nem kódoló szakaszok általában)

+ az informatika belépése: a technológia miatt rengeteg adatunk van, ebben kell bányásznunk, keresnünk

12. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ: DNS-láncon mutációk: egyes pontok villognak

Ez egy egyszerű animáció: egymás mellett van 3 DNS-spirál, és 5-6 azonos helyzetben lévő pontjuk más színnel villog, ez jelzi, hogy ezen a pontokon eltérnek egymástól (mutáció).

Minta (ezt kellene folytatni jobbra, további 4-5 eltéréssel):

Előadó: az SNP-k előfordulási mintázatai alapján csoportokba lehet osztani az embereket egy-egy tulajdonság (pl. betegségekre való fogékonyság, gyógyszerre való válaszreakció) szempontjából.

13. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: SNP-PROFILOK

forrás: http://nci.nih.gov/cancertopics/understandingcancer/geneticvariation/Slide37

14. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: HAPMAP WEBES SCREENSHOT

Ide kell majd egy olyan program, ami kifényképezi a képernyőn látható mozgásokat. Bemegyünk a nagy nemzetközi SNP-adatbázisba, és megnézünk egy gyakori betegséget ebből a szempontból. Ezt a néhány kattintást vesszük fel (nem kockáztatjuk a helyszíni élő internetet). http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/

15. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: CNV-K ÁBRÁZOLÁSA; a kép azt ábrázolja, hogy egy bizonyos genetikai információ (egy szekvenciarészlet) különböző kópiaszámban fordulhat elő

Minta:

Változtatás az ábrán: mindegyik henger kék legyen, a jobb oldali ábrán lévő fehér is (tehát mindegyik egyszínű legyen)

16. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: HUNTINGTON-KÓROS EMBER, MINT A GENETIKAI DETERMINIZMUS SZÉLESŐSÉGE PÉLDÁJA, a betegség előtt és után

A projektnek engedélyt kell kérni az alábbi képek használatához (az oldalon a 3. eset):

http://www.hdsa.org/living-with-huntingtons/wallrem.html

Előadó: a mikroRNS-forradalomról

17. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ: MIKRO-RNS-EK MŰKÖDÉSE

Magyarázó ábra:

Minta animáció:

http://www.youtube.com/watch?v=_-9pROnSD-A&feature=related

Nem 3 D-ben kellene, ez csak minta. A folyamatot a grafikussal szeretném átbeszélni majd.

Előadó: A sejtek működése egy több szinten szabályozott, bonyolult rendszer:

18. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP/ANIMÁCIÓ: HIERARCHIA ÁBRA

Az ábra felső részén a háromszög látszik statikusan, az alábbi szöveggel:

GENOM

TRANSZKRIPTOM

PROTEOM

Bal oldali nyilaknál szövegek: gén – mRNS – fehérje

Jobb oldalon: komplexitás

Az illusztráció alsó részén pedig az alsó ábra elemei jelennek meg egymás után; a rajzolt szív helyett egy igazi kép kellene a szívről. Feliratok (a zárójelben lévő számok maradnak):

GENOM - gének

TRANSZKRIPTOM – mRNS-k

PROTEOM – fehérjék – módosított fehérjék

FENOTÍPUS

METABOLOM – metabolitok

(a vastagbetűs kis szövegek nem kellenek)

Előadó: Mindezek következtében hatalmas adathalmazaink vannak, szinte belefulladunk az adatok tengerébe?

19. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ: BIOLÓGIAI ADATOK ISZONYATOS TENGERE

Ez kreatív grafikai munkát igényel. Az ötletünk egy hatalmas adatáradat, ami felülről lefelé zuhog, mint a Mátrix c. filmben, csak betűk helyett biológiai adatok, pl. szekvenciák (Google: genome sequencing), fehérjeszerkezetek (Google: protein structure), genomtérképek (Google: genome map), kromoszómatérképek (Google: chromosome map), sőt Nature és Science címlapok esnek lefelé óriási mennyiségben, kaotikus benyomást keltve; a kép alján egy kétségbeesett ember feje látható, aki nem tudja, hogyan lehet ebben eligazodni.

Előadó: Átlátható-e ez? Nem reménytelen-e eligazodni benne? Lehet-e rendszert találni benne? Igen, mindez átírta a szimpla „mutasd meg a géntérképed, és megmondom, ki vagy” felfogást; genetikai dogmatizmusunk átalakult; ma már tudjuk, hogy ez egy igen komplex rendszer: gének és környezet, genom és epigenom, informatika, rendszerbiológia.

20. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ: NAGY RENDSZERBIOLÓGIA ÁBRA, 1-3. FÁZIS

Ez a legfontosabb illusztrációnk. Azt akarja érzékeltetni, hogy a biológiai folyamatok egyes elemei, szintjei hálózatokba szerveződnek, egységes rendszert alkotnak (system biology). Ez egy 3D-s animáció lenne, amely 3 fázisból áll.

Első fázis: az előző adattengerből áttűnik egy ránézésre is nagyon bonyolult hálózati ábra, amely körben forog. Minta:

Második fázis: zoom a fenti ábra egy kisebb területére, ahol közelebbről láthatjuk a hálózat egy részét. Fontos, hogy a különböző méretű és színű csomópontokat piros és kék vonalak kötik össze, amelyek különböző vastagságúak.

Harmadik fázis: további zoom a második fázis egyik csomópontjába, ahol előtűnik az alábbi konkrét példa:

Ez az emberi vastagbélrák biológiai hálózata, a jelkulcsok nem kellenek.

Az egésszel tehát azt szeretnénk érzékeltetni, hogy a látszólagos káoszban van rendszer, meg lehet találni benne a rendszert.

Előadó (kb. eddig tartott az előadás egyharmada): most kezdődik a rendszerszemléletű orvostudomány; példák, mit érdemes vizsgálni, etnikai eltérések – roma egészségügy; egészen konkrét példákat mondani nagyon jó és szép történetekre, szűrésekre, járványokra (pl. H1N1). öregedés kérdése. Kik alakítják/használják ezt a rendszert? Kutatók, informatikusok és orvosok.

21. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁLT KÉP

Először megjelenik egy orvos munka közben, aztán egy kutató a laborban, végül egy informatikus a monitor előtt; ezután mindenki mindenkivel összekötődik, jelezve a területek közötti kapcsolatot. Ezután a kutató az előtérbe mozog, és megjelenik mellette a Biobank szó.

Ezután vált a kép, és feltűnik egy háromszög, amelynek belsejében a Jogi kérdések felirat van, csúcspontjaiban pedig az alábbiak: Egyén joga, Kutatáshoz való jog, A jövő generációinak jogai

Ki szeretné tudni?

http://nci.nih.gov/cancertopics/understandingcancer/genetesting/Slide35

Előadó: az etnikai eltérésekről beszél:

22. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: oriental baba, afrikai baba

Előadó: roma biológia:

23. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: roma baba

Előadó: ennek a konklúziója: a különbözőséget figyelembe kell venni az egészségügyben.

VISSZATÉRÜNK A 3D-S HÁLÓZAT ÁBRA ELSŐ FÁZISÁHOZ, ÉS BELEZOOMOLUNK AZ EGYIK HÁLÓZATI CSOMÓPONTBA, AMINEK A VÉGÉN EZT A SZÖVEGET LÁTJUK: SZEMÉLYRE SZABOTT ORVOSTUDOMÁNY

Előadó: két határozott terület: farmakológia, vakcináció; szóban mindkettőről beszél, illusztrációban a farmakológiát mutatjuk

24. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ: személyre szabott orvostudomány

Az 5. illusztrációval megegyező típusú animáció, egyre mélyebbre zoomolgatunk. A folyamat:

két ugyanolyan animáció fut egymás mellett

szájüreg: bevesz valaki egy gyógyszert, az lemegy a gyomorba, egy sejtbe lépünk be, a sejtek elkezdik a lebontást (sematikus ábrázolással, pl. kis ollók szétdarabolják)

innen eltér a két animáció:

az egyik esetben gyorsabban, a másik esetben lassabban bontják a sejtek a gyógyszert

váltás: két recept jelenik meg egymás mellett, mindkettőn ez szerepel:

„a” gyógyszer

„b” gyógyszer

végül egy mozgó ceruza az egyik esetben az „a”-t, a másik esetben a „b”-t karikázza be

MEGINT VISSZATÉRÜNK A 3D-S HÁLÓZAT ÁBRÁ ELSŐ FÁZISÁHOZ, ÉS BELEZOOMOLUNK AZ EGYIK HÁLÓZATI CSOMÓPONTBA, AMINEK A VÉGÉN EZT A SZÖVEGET LÁTJUK: KÖRNYEZETI HATÁSOK (EPIGENETIKA)

25. ILLUSZTRÁCIÓ: ANIMÁCIÓ: környezeti hatások (epigenetika)

Az 5. illusztrációval megegyező típusú animáció, egyre mélyebbre zoomolgatunk. A folyamat:

szájüreg: étel, ami lemegy a gyomorba, egy sejtbe lépünk be, a sejtek elkezdik a lebontást (sematikus ábrázolással, pl. kis ollók szétdarabolják)

váltás után: egy DNS-spirál részletét látjuk közelről, amelyhez kis, különféle színű zászlócskák vagy gömböcskék kapcsolódnak éppen (ez a kaja hatása: kisebb molekulák kapcsolódnak a DNS-hez); itt lehet látni a folyamatot, de ez csak példa:

http://learn.genetics.utah.edu/content/epigenetics/intro/

váltás a nagy 3D-s ábra MÁSODIK fázisához: jól láthatóan megváltoznak a csomópontok közötti kapcsolatok – a csomópontok maradnak!

Innen már csak néhány kép és egy ábra lesz.

javaslat: KÉP: nagyszülő unokával (a svéd példához)

javaslat: életmód hatása a telomeráz aktivitásra

Utolsó rész: kommunikáció és oktatás szerepe

26. ILLUSZTRÁCIÓ: KÉP: Tudományos halandzsa, középen egy ember áll és fogja a helyet,

A személet, világkép, világnézet szerepe, művelődés, oktatás

Etika, jog, adatvédelem – ez már a kerekasztal, az előadásban csak felvillantjuk

A testünkről és a világról való sokkal komplexebb gondolkodás, amit az oktatásban, az iskolában kell elkezdeni; a műveltséghez tartozik a testünk ismerete

Záró illusztrációk: Bevennék valami ilyet- bioszféra-infoszféra- endoszféra kolcshatas

L: csatolmany

Endoszféra heyett: szervezet, de ez a bioszférán belül legyen

science photo library:

Yeast protein interaction map

Split personality

Schizophrenia

M245/1042 Rights Managed

http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/

Project Data: első

Landmark or Region: asthma

Matches on chrX

NM_176786.1